导致胎儿畸形的原因，既有遗传因素，也有环境因素，或二者兼而有之，称作综合因素。医学遗传学专家经过研究后估计，其中有10％是由单基因遗传病或染色体病引起的，10％左右可能完全是由环境因素引起的，80％可能是由遗传因素与环境因素相互作用引起的先天性畸形。

    如果说，遗传因素是导致胎儿畸形的内因，那么环境因素就是导致胎儿畸形的外因。综合因素是内因外因交叉的结果。

    人的智力、体质既由先天因素决定，又受后天养育因素的影响。认为孩子的聪明与呆笨都是先天造就的，是不可改变的，这是不科学的。生一个健康、聪明的孩子，先决条件是遗传基因正常。而后天养育因素包括胎儿在生长发育过程中避免外界不良环境的影响，也是至关重要的。大量临床和实验证实，许多药物能造成胎儿畸形。环境污染如大气、水质、土壤和食品受到有毒物质的污染，能造成流产、死胎、胎儿畸形和遗传性疾病。父母工作中接触化学性物质如铅、汞、汽油、氯乙烯及乙醚等，接触物理因素如放射线、噪声、微波辐射等，都可直接对生殖细胞产生影响，引起对胎儿的遗传损伤。孕妇感染病毒性疾病，可引起流产、早产、死胎、新生儿畸形。夫妻大量吸烟、酗酒，影响胎儿生长发育。

另外，难产、助产、脐带绕颈、严重窒息等，都会影响孩子的智力发育。