抗生素长期使用会使肠道内大部分敏感细菌抑制，从而破坏正常菌群间的括抗作用，最后引起腹泻，这种现象称抗生素相关性腹泻。现已查明，本病是由难辨棱状芽胞杆菌的毒素所致，由于肠道正常菌群间平衡关系被抗生素打破，这种致病菌便乘机过度增殖并产生致病毒素，引起腹泻等症状。实际上，抗生素相关性腹泻也是一种二重感染。

    为什么抗生素在应用过程中会发生腹泻？本病可分为两类：

  （1）伪膜性肠炎 以林可霉素和克林霉素引起的最多，其次是头孢菌素，氨苄西林和四环素。其临床表现：起病较缓、腹痛腹泻，老人、体弱和重症者可有大量水样便或含粘液和脓血，少数可排出斑块状假膜，全身症状逐渐加剧，伴有发热、腹胀和恶心呕吐，出现严重电解质素乱、循环衰竭，本病治疗时间较长（平均30天），预后较差，有死亡病例。
  （2）急性出血性肠炎 主要由半合成青霉素引起，以氨苄西林最多。临床表现：发病急，突然腹痛，呈绞痛，排血便，多发生于青年女性。一旦停药，病情即可好转，治疗时间平均10天，预后一般较好。