多粘菌素毒性较大，尤其多粘菌素B较E毒性大，在使用时应注意以下问题：

  （1）可损害肾脏出现蛋白尿、血尿等、停药后可恢复。有肾脏疾病患者，宜减量使用或间歇用药。用药期间应定期验尿，以免发生肾毒性。

  （2）可引起明显神经系统毒性，表现为头部、口舌及肢端麻木或感觉异常、眩晕、乏力，共济失调等，停药后也可消失。用药期间应停止开车、开机器等危险工作，以免发生事故。

  （3）少数病人可发生过敏反应，应及时停药。
  （4）大剂量快速滴注时，易发生肌无力、呼吸抑制等，应防止用量过大并且缓慢滴注。

  （5）肌注时局部疼病明显，可加用局麻药以缓解，但含局麻药的针剂禁止静滴。

  （6）为防止毒性反应发生，疗程以不超过2周。