临床上治疗阿米巴病时，应根据不同症状及时期的病情来选择治疗药物，一般在选择抗阿米巴病药时应遵循以下原则：

  （1）无症状排包囊者 可选用喹碘方等卤化喹琳类。

  （2）轻度阿米巴痢疾 可选用甲硝唑以消灭肠壁和肝脏的滋养体，同时并用卤化喹琳类以提高治愈率。

  （3）重症阿米巴痢疾 可首选甲硝唑治疗，疗程结束后，可再用肉化喹琳类一个疗程以求根治，对重症不能口服者可先用吐根碱深部皮下注射或肌肉注射4~6天，以控制症状，再用甲硝唑和卤化喹琳类。

  （4）阿米巴肝脓肿和其他肠外阿米巴病 甲硝唑是治疗阿米巴肝脓肿最简单、安全而有效的药物，个疗程后，继以卤化喹琳类。其他肠外阿米巴病治疗同肝脓肿，但氯喹疗效略差。