引起男性不育症的原因很多，如先天发育异常、内分泌功能失调、性机能障碍及生殖道感染，乃至心理因素等。

    内分泌问题   主要原因是促性腺激素缺乏。一些激素水平的低下或紊乱将直接导致性机能减退，影响生育。   

    输精管道梗阻   很明显，输精管道的梗阻必然会影响精子的输送。据统计，先天性输精管道畸形引起的不育，占生育能力低下者的1．3％。输精管道梗阻通常由生殖系统感染如附睾、前列腺、精囊的炎症及附睾、输精管结核等引起，这些感染多可致输精管道部分或完全梗阻而影响精子的运输与排出。少见的有附睾、前列腺原发性或转移性肿瘤，以及外伤或手术损伤输精管道而导致的梗阻。

    睾丸生精功能异常   常见于隐睾和精索静脉曲张，毒素、磁场、高热和外伤等理化因素也可引起睾丸的生精障碍。精索静脉曲张在男性中的发病率较高，据调查，约16％的10～19岁的青少年有左侧精索静脉曲张。为什么精索静脉曲张会引起不育?主要因为静脉曲张、血流郁滞导致阴囊温度升高，血流不畅导致营养障碍，影响精子生成，它还能影响到内分泌功能从而干扰精子的生成。

    免疫性不育  男性自身产生的抗精子免疫抗体和女性产生的抗精子免疫抗体均可引起针对精子的免疫反应，其后果就是杀死精子，导致不育。

    男性性功能障碍  勃起功能障碍、早泄、不射精和逆行射精均可影响到精子与卵子的结合，引起男性不育。