(1)合成孕激素：可用炔异诺酮、炔诺酮、甲地孕酮、氯地孕酮、甲羟孕酮等药物作周期治疗，使异位的子宫内膜退化。

    一般从月经周期第六日开始至第25日，每日1次口服上述药物当中的一种5～10毫克，疗程视治疗效果而定，此法可抑制排卵。若希望生育者，可以从月经第16日开始服至第25日，用炔异诺酮或炔诺酮10毫克，每日1次。这样既可控制子宫内膜异位症造成的痛经，又不至于影响排卵。

    此外，还有人主张应用大剂量合成孕激素3～10个月，造成假孕状态，使异位的子宫内膜组织产生脱膜反应，继之坏死，最后被吸收而消失。应用剂量应由小逐渐加大，在预计月经来潮前一周开始，服甲地孕酮1次4毫克，每日2次，连服1周；第二周1次4毫克，每日3次；第三周1次8毫克，每日2次；第四周以后逐渐增加剂量至20毫克，每日1次。或服炔异诺酮或炔诺酮5毫克，每日1次；第二周继之10毫克，每日1次；第三、四周15毫克，每日1次；第五、六周20毫克，每日1次；第七、八周30毫克，每日1次；第九、十周40毫克，每日1次，直至症状及体征改善或缓解为止。假孕疗法至少应持续3个月，最长可达2年，这种疗法约有80％的患者确能显著改善其症状及体征，但也有约20％的患者在治疗后半年又有复发。

    (2)睾酮：对子宫内膜异位症也有一定疗效。剂量应随着耐受量而定，开始剂量可为10毫克，每日2次。于月经周期后2周开始。口含化内服，这一剂量很少有影响周期及发生男性化的不良反应。但要达到镇痛目的。常需持续几个周期。此后可减少用量，再持续治疗一个时期后，停药观察。如能妊娠则本病即可治愈。也有每日1次口服甲睾酮10毫克，或肌内注射丙酸睾酮25毫克，每周2次，6～8周为1个疗程。两疗程之间，至少停药4周。这一治疗方法，可以引起月经延迟，月经量减少甚至闭经，但停止治疗后均可以恢复。

    (3)手术治疗：手术治疗是有效的治疗方法。对药物有反应或药物治疗无效者可实施手术治疗。

    如为内在性子宫内膜异位症，年龄接近40岁，或已有子女，不伴有外在性子宫内膜异位者，可行全子宫切除术，保留双侧附件。但有外在性子宫内膜异位症而病灶不能清除者，则应将附件切除。如年轻人要求保留生育能力而子宫内膜异位症仅局限在子宫一处，可行病变区域剜除术。

    (4)放射治疗：病灶位于肠道、泌尿道或盆腔结缔组织等处不易进行手术，或内分泌治疗效果不好，或接近绝经期的复发病例，或患者身体情况差，或其他原因如过于肥胖，对手术有很大顾虑等，也可采取放射治疗，造成人工绝经。一般用宫腔镭疗或钴60放射治疗，能破坏卵巢功能，使异位内膜萎缩。