慢性盆腔炎最易与子宫内膜异位症混淆。子宫内膜异位症痛经较显著，这种痛经常常并不是先天的有遗传倾向的那种痛经，大多数是后来逐渐出现的，并且这种痛经会一次比一次加重，直至患者无法忍受。继发性的进行性的痛经是子宫内膜异位症最有代表性的典型临床表现。若能通过查体触摸到典型结节，有助于诊断。鉴别困难时可进行腹腔镜检查。在腹腔镜下可以清楚地鉴别这两种疾病。