这一时期的妇女生殖系统会发生明显的变化，比如外阴由于失去雌激素的作用，外阴皮下脂肪逐渐减少、变薄、失去饱满。阴道黏膜增生性降低，上皮变薄，皱褶消失，逐渐变平。子宫颈上皮及平滑肌随雌激素的下降而逐渐萎缩，体积变小，由生育时期的球形逐渐变扁平，穹隆消失。子宫体平滑肌逐渐萎缩消失，大部分被纤维结缔组织代替。子官逐渐缩小为长5cm的索状物。重量由50g左右变为30g左右。宫体与宫颈的比例又恢复到1：2状态。
    子宫内膜受雌激素的影响最明显，绝经前期表现为黄体功能不全，或成为无排卵性周期特征的增殖期子宫内膜。绝经后初期为子宫内膜成为无周期变化的过渡型，而此后无周期变化的子宫内膜会变薄，不再生长、脱落。输卵管上皮及肌纤维萎缩。卵巢体积明显缩小，由生育时期的4cm x3cm x 1cm变为近一条索状物。卵泡消失，血管萎缩，弹力纤维消失，表面苍白、质硬。