一些研究发现，服用含新型孕激素去氧孕烯或孕二烯酮及20～30tzgEE的OCs与含左炔诺黄体酮及相同剂量雌激素的OCs相比，静脉血栓形成的风险轻度增加。对此至今为止仍有很大的争议。一些研究结论是“易感者消耗”“负面选择”及“健康使用者偏倚”可解释血栓形成明显增高。服用OCs导致的静脉血栓大多数在最初几个月内发生。因此，与已经服用OCs一段时间且没有发生病变的妇女比较，新近服用人工合成的新型OCs的妇女被证实血栓形成明显增高。同样，医生有可能推断新型OCs更安全，故选择性地给有高危因素的妇女使用新药。
    欧洲一项大型针对服用不同OCs患血栓疾病的妇女研究资料分析表明，尽管最新型的药片含有雌激素剂量最低，但最早推荐的低剂量药片血栓形成的风险最低，而那些最新推荐的药片风险最高。相反．两个大型荟萃分析研究的结论是，服用含有去氧孕烯或孕二烯酮OCs妇女，静脉血栓形成和栓塞(VTE)风险有低水平的增加。该两项研究发现VTE的相对危险度均为1．7。估计服用OCs的年轻妇女VTE的绝对危险度，其中含EE和左炔诺黄体酮的OCs为1．5/10000，而含EE和去氧孕烯/孕二烯酮的OCs为2．6/10000。因为绝对危险度仍很小，相关争议尚不能通过观察资料彻底解决。